江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達(dá)量與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析

      解耦聯(lián)蛋白(uncoupling protein, UCPs)是線(xiàn)粒體上的質(zhì)子載體，以質(zhì)子漏方式把H+從外膜傳遞到內(nèi)膜(Ricquier, Frédéric, 2000)。在氧化磷酸化過(guò)程中，可以降低膜內(nèi)外的電化學(xué)梯度，在電子傳遞過(guò)程中實(shí)現(xiàn)質(zhì)子回流，從而起到讓呼吸鏈與ATP合成過(guò)程解耦聯(lián)的作用，使能量以熱能的形式散發(fā)，氧化磷酸化合成ATP 的效率下降(張雷等, 2010)。UCP3 基因是UCPs 家族成員之一，與UCP2 基因緊密連鎖并定位于豬的9 號(hào)染色體(Stone et al.,2015)。當(dāng)受到脂肪酸刺激時(shí)，UCP3 基因表達(dá)量上調(diào)，且UCP3 蛋白參與脂肪酸和其他陰離子跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)(Lapice et al., 2017)。UCP3 活性對(duì)脂肪酸氧化和氨基酸代謝及其相關(guān)的生化途徑具有重要調(diào)節(jié)作用(Aguer et al., 2016)。所以，很多畜禽研究者將其作為一個(gè)影響肉品質(zhì)的重要功能候選基因展開(kāi)研究。方美英等(2002)在對(duì)豬(Sus scrofa) UCP3 基因多態(tài)性的研究中，在內(nèi)含子3 發(fā)現(xiàn)了T272G變異位點(diǎn)。李艷華等(2006)分析了長(zhǎng)白豬、杜洛克等5個(gè)國(guó)內(nèi)外豬種UCP3 基因的多態(tài)位點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)位于啟動(dòng)子區(qū)的SNPs位點(diǎn)會(huì)造成轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的改變，影響對(duì)UCP3 基因的轉(zhuǎn)錄和調(diào)控，從而影響豬的生產(chǎn)性能。陳哲(2011)在UCP3 基因cDNA上檢測(cè)到A448G突變位點(diǎn)，并發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)等位基因A對(duì)于改善豬脂肪性狀具有積極作用。王陽(yáng)等(2011)研究發(fā)現(xiàn)UCP3 參與豬骨骼肌細(xì)胞脂肪代謝的調(diào)節(jié)，從而影響地方豬種的肉質(zhì)和其他性狀。但是關(guān)于UCP3 基因表達(dá)量與肉質(zhì)性能之間的相關(guān)性尚未見(jiàn)研究報(bào)道。

      本研究以貴州優(yōu)良地方品種江口蘿卜豬為實(shí)驗(yàn)材料，屠宰后測(cè)定其11 項(xiàng)主要肉質(zhì)性能指標(biāo)，并提取背最長(zhǎng)肌中的基因組DNA建立混合DNA池，擴(kuò)增UCP3 基因全部外顯子并測(cè)序，初步篩選多態(tài)位點(diǎn)，然后以單個(gè)樣本DNA為模板，擴(kuò)增篩選到的位點(diǎn)對(duì)應(yīng)外顯子，用以測(cè)序驗(yàn)證并分型。對(duì)應(yīng)肉質(zhì)指標(biāo)，對(duì)不同基因型豬進(jìn)行肉質(zhì)性能差異分析。提取背最長(zhǎng)肌總RNA，檢測(cè)不同基因型江口蘿卜豬背最長(zhǎng)肌中UCP3 基因的平均表達(dá)量做差異顯著性分析，分析基因型、表達(dá)量與及肉質(zhì)性能三者之間的關(guān)聯(lián)性，以期探尋UCP3 基因多態(tài)性對(duì)江口蘿卜豬肉質(zhì)性能的影響，為科學(xué)的選種選育提供基礎(chǔ)材料。